蛋白質組學的哪些方面與計算機有關？

蛋白質組一詞來源於蛋白質和基因組這兩個詞的雜交，意思是“基因組表達的一整套蛋白質”，即細胞甚至生物體表達的所有蛋白質。 蛋白質組本質上是指對蛋白質特性進行大規模的研究，包括蛋白質表達水平、翻譯後修飾、蛋白質-蛋白質相互作用等，從而在蛋白質水平上獲得對疾病發生、細胞代謝等過程的整體性、全面的了解。

什麼是蛋白質組學研究。

1.蛋白質鑑定：蛋白質鑑定可採用一維電泳和二維電泳結合蛋白質和其他技術，使用蛋白質晶元、抗體晶元和免疫共沉澱技術進行。

2.翻譯後修飾：許多 mRNA 表達產生的蛋白質會經歷翻譯後修飾，例如磷酸化、醣基化、酶原啟用等。

翻譯後修飾是蛋白質調節其功能的重要途徑，因此蛋白質翻譯後修飾的研究對闡明蛋白質的功能具有重要作用。

3.蛋白質功能測定：細胞因子的生物分析，如酶活性分析和酶底物測定、配體-受體結合測定。

基因敲除和反義技術可用於分析基因表達產物-蛋白質的功能。 此外，研究表達後蛋白質在細胞中的定位，在一定程度上也有助於了解蛋白質的功能。 Clontech 的螢光蛋白表達系統是研究細胞內蛋白質定位的絕佳工具。

4.對於人類來說，蛋白質組學的研究最終服務於人類健康，主要是為了促進分子醫學的發展。 比如尋找藥物的靶分子。

許多藥物本身就是蛋白質，許多藥物的靶分子也是蛋白質。 藥物還可以干預蛋白質-蛋白質的相互作用。

現在我正在研究蛋白質功能和調控網路，我需要生物資訊學知識，很多動物都有已知的序列，我們可以用計算機來尋找它們的進化關係，推斷出蛋白質的相似功能，而蛋白質調控涉及使用基因晶元來獲得蛋白質關係，我們需要使用相應的基因晶元資料和軟體模擬來獲得最終的網路關係。 結論出來後，就要使用相關的軟體進行評估和分析。

此外，還包括蛋白質的三維結構，蛋白質的功能修飾和修飾，都有相應的軟體進行模擬，總之，生物資訊學滲透到前沿生物領域的方方面面，只要你能想到，就可以用生物資訊學來解決。

核酸測序是ATGC的多種組合，但涉及蛋白質組學的常用氨基酸有20多種，複雜得多，蛋白質也有各種翻譯後修飾、高階結構等。 此外，蛋白質不如核酸穩定，容易降解，因此在研究中獲得可重複的結果更加困難。

蛋白質組學側重於基因調控的動態描述，基因表達蛋白水平的定量測定，疾病和藥物對生命過程影響的鑑定，以及基因表達調控機制的解釋。 作為一門科學，蛋白質組學研究不是從零開始的，它是已經存在了 20 多年的蛋白質（肽）分析和基因產物分析技術的延伸。 肽圖分析依賴於二維凝膠電泳 （2-DE） 和進一步的影象分析。 基因產物分析依賴於多種分離後分析，如質譜技術、氨基酸成分分析等。

由於可變的片段和 RNA 的存在，許多基因可以表達許多不同的蛋白質。 因此，蛋白質組的複雜性遠高於基因組的複雜性。

如果乙個物種的整個基因組序列已被破譯，並不意味著該物種的蛋白質組也被破譯。 基因蛋白質產物的具體分析應結合基因組水平、轉錄水平和翻譯水平的修飾和調控來確定。